No. 27 (2007)
Articles

SNP analysis of ITS1-5.8S-ITS2 rDNA loci in modern and ancient melons (Cucumis melo)

Published November 15, 2007
Zoltán Szabó
1Szent István Egyetem Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar, Genetika és Biotechnológiai Intézet, Gödöllő 2Növénytani és Ökofiziológiai Intézet, Gödöllő 3Missouri State University, Department of Agriculture, Mountain Grove, USA
Gábor Gyulai
Szent István Egyetem Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar, Genetika és Biotechnológiai Intézet, Gödöllő
Zoltán Tóth
Szent István Egyetem Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar, Genetika és Biotechnológiai Intézet, Gödöllő
László Heszky
Szent István Egyetem Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar, Genetika és Biotechnológiai Intézet, Gödöllő
pdf

APA

Szabó, Z., Gyulai, G., Tóth, Z., & Heszky, L. (2007). SNP analysis of ITS1-5.8S-ITS2 rDNA loci in modern and ancient melons (Cucumis melo). Acta Agraria Debreceniensis, (27), 120–124. https://doi.org/10.34101/actaagrar/27/3114

ITS (internal tanscribed spacer) profiles of the aDNA (ancient DNA) of seed remains extracted from an extinct sample recovered from the 15th century (Budapest, Hungary) were compared to 31 modern melon cultivars and landraces. An aseptic incubation followed by ITS analysis was used to exclude the exogenously and endogenously contaminated (Aspergillus) medieval seeds and to detect SNPs in ITS1-5.8S-ITS2 region of rDNA (ribosomal DNA). SNPs were observed at the 94–95 bp (GC to either RC, RS or AG) of ITS1; and at 414 bp (A-to-T substitution), 470 bp (T to Y or C), 610 bp (A to R or G) of ITS2. The results facilitate the final aim of molecular and morphological reconstructions of ancient melon tpyes.

Downloads

Download data is not yet available.